Ao abrigo do convénio existente entre a Universidade dos Açores e a Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto são ministrados na Universidade dos Açores os dois primeiros anos do curso conducente ao grau de mestre em Ciências Farmacêuticas pela Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto. 
Os alunos que concluírem com aproveitamento os dois primeiros anos do curso prosseguem estudos Faculdade de Farmácia da Universidade do Porto, ingressando no 3.º ano do curso.

Este curso em Ciências Farmacêuticas destina-se a formar profissionais habilitados a exercer as atividades tradicionalmente associadas à profissão farmacêutica, nomeadamente ao nível da: a) farmácia de oficina; b) farmácia hospitalar; c) indústria farmacêutica (desenvolvimento, fabrico, controlo de qualidade, marketing e assuntos regulamentares); d) distribuição grossista de medicamentos, e) análises clínicas e variadas outras atividades de índole analítica (análises químicas, hidrológicas, bromatológicas, microbiológicas, toxicológicas, etc.); f) ensino e investigação. Em particular, destina-se a formar profissionais devidamente habilitados a exercer com exclusiva competência e responsabilidade as atividades que integram o conteúdo do Ato Farmacêutico (Decreto-Lei n.º 288/2001).

O licenciado em Ciências Farmacêuticas fica capacitado para desenvolver a sua atividade profissional nas seguintes áreas: a) atividade farmacêutica (farmácia comunitária, farmácia hospitalar, distribuição farmacêutica, indústria farmacêutica); b) análises clínicas; c) análises microbiológicas; d) análises hidrológicas; e) análises toxicológicas; f) indústria agroalimentar; g) outras com componente químico-biológica.

Ao abrigo do convénio existente entre a Universidade dos Açores e a Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade de Lisboa, são ministrados na Universidade dos Açores os dois primeiros anos do curso conducente ao grau de mestre em Medicina Veterinária pela Faculdade de Medicina Veterinária da Universidade Lisboa. Os alunos que concluírem com aproveitamento os dois primeiros anos do curso prosseguem estudos na Universidade de Lisboa, ingressando no 3.º ano do curso.

O Mestrado Integrado em Medicina Veterinária, tem como objetivos específicos: a) garantir uma formação veterinária adequada, alicerçada na investigação científica, no decurso da qual os estudantes aprendam a zelar pela saúde e bem-estar dos animais, a contribuir para uma produção animal sustentada, competitiva, em respeito pelo meio ambiente, a proteger o Homem das zoonoses e a garantir a qualidade e segurança dos produtos alimentares de origem animal; b) ministrar uma formação de elevado nível, no fim da qual os estudantes demonstrem, entre outras competências, saber aplicar os seus conhecimentos e a sua capacidade de compreensão e de resolução de problemas em contextos alargados e multidisciplinares, na área das Ciências Veterinárias; c) desenvolver aptidões para integrar conhecimentos, lidar, com ética e responsabilidade, com questões complexas, e ser capazes de comunicar os seus raciocínios e as suas conclusões de uma forma clara e objetiva; d) desenvolver competências que lhes permitam uma aprendizagem ao longo da vida, de um modo autónomo.

O licenciado em Medicina Veterinária fica capacitado para desenvolver a sua atividade profissional nas seguintes áreas: a) clínica de animais de companhia, incluindo os novos animais de companhia; b) clínica das espécies pecuárias; c) sanidade animal; d) produção e nutrição animal; e) inspeção sanitária de alimentos; f) tecnologia dos produtos de origem animal; g) saúde pública veterinária; h) investigação científica.